Il faut que ta fenêtre soit au premier plan. Essaye en fenêtré et en plein écran voir si une des deux fonctionne.
Pour les API c'est marqué des fois sur internet, sinon quand rien ne fonctionne on en déduit que c'est un problème d' API.
Pour ton logiciel à priori (j'ai regardé pour :
http://www.cheatengine.org/ ) il y avait un bug sur les API qui a été résolu en mai 2012. Du coup si ta version est pas à jour met là à jour, mais je te fais confiance là-dessus.
Bon je connais pas le logiciel, du coup j'ai chopé une photo sur internet à la va-vite. C'est quel bouton qui fonctionne pas ? File ou First Scan ou une icône ?
Tu as bien fait un Clic gauche de la souris(je demande au cas ou)
Tu peux nous filer une portion de code ? Là ou ça bug par exemple